中山大学附属第三医院耳鼻咽喉头颈外科是国家重点学科，国家临床重点专科建设项目，同时还是广东省临床重点专科和国家级耳鼻咽喉科住院医师培训基地；学科集医疗、教学和科学研究为一体，是国务院学位委员会批准的耳鼻咽喉科学硕士（1985年）、博士学位（1997年）授予单位及博士后科研流动站（1997年）；同时亦是教育部临床医学专业五年制本科规划教材、国家卫健委临床医学专业五年制、七年制和八年制规划教材的编委单位。设有六个亚专科，鼻科（包括鼻颅底专业组）、变态反应（过敏）科、咽喉头颈科、耳外科、耳内科和小儿耳鼻咽喉科。设置七个临床诊治中心：内镜诊疗中心，临床听力检测与研究中心，眩晕临床诊疗中心，鼻眶颌颅底中心、鼻变态反应性疾病诊疗中心，睡眠呼吸（鼾症）监测中心，鼻通气功能评估中心。建立了六个实验室和研究室：分子生物学实验室，鼻生理功能研究室，鼻变态反应研究室，耳鼻咽喉头颈解剖实验室，临床听力研究室，睡眠呼吸障碍研究室。集结了一批国内一流的专家学者，承担着医疗、教学、科研多重任务。